直到……鬼才知道过了多久后，某昏迷的皮卡丘终于醒了过来。
＂皮卡皮。（陌生的天花板。）＂
＂啊，你醒啦。＂大木博士的声音把皮卡丘那不知道发散到哪里的拉了回来。
皮卡丘斜了一眼大木博士，便起身查看周围。很明显自己又回到了真新镇的研究所里。
＂盯—————————＂皮卡丘在把大木博士盯得发毛之后，把头一歪摆出了一个疑惑的表情。
＂那个＂大木博士擦了擦汗，向皮卡丘解释道：＂欢迎回来，现在距离你和你的训练家出发已经过去三天了＂
皮卡丘点了点头，示意大木博士继续。
（额，完全肯定这是只高智商精灵了…）大木博士继续说道：＂你和小智都在镇外昏迷了，居民发现了你们把你们带了回来。＂
皮卡丘继续点头。
＂那个，虽然确定你是拥有高智商的精灵，但请问你会写人类的文字吗？或者画图？＂大木博士的笑容有些勉强，显然觉得自己的要求有些强人所难，＂虽然你已经醒了，小智已经确定没有受到伤害，也已经有了苏醒的迹象。但…发生了一些状况……虽然是向好的方向进行了改变，但这实在有些太不科学了…请问当时发生了什么？＂
皮卡丘皱了皱眉，大木博士的话不是一般的诡异。
小智还在昏迷中，已经快醒了，但他身上发生了一些好的、不科学的状况……
这是啥意思？
＂他突然昏过去了，然后我也突然昏过去了…所以你也完全不明白出什么事啊。＂看着皮卡丘递过来的，写着歪歪扭扭的字的纸片，大木博士叹了口气，把皮卡丘放在了肩上，＂你肯定很疑惑吧。来看一下吧，小智出了什么事。毕竟他也是你的训练家啊。＂
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十分钟后，小智家中。
“……”皮卡丘呆滞地看着床上躺着的少年，良久后才在大木博士递过来的纸上写下一行字，“博士，这货是谁啊？”
“小智吧…大概。”大木博士不确定地说到，“刚刚发现你们的时候小智还是原来的样子，1天之后就出现了明显的改变。现在已经变成这样了。”
皮卡丘揉了揉眼睛，再次看向躺在床上的骚年。
眼前的小智，原本的墨绿色短发已经变成了纯黑的碎发。四肢明显变长了一节，腰细了一圈，肩膀变阔。而变化最大的，则是变得尖尖的下巴和鼻子，以及只剩下2/3粗细的肢体。
总之，虽然身上还有小智的影子，但…
“真是充满了鲁鲁修的即视感。”皮卡丘在心中默默的吐槽。
“嗯…”就在这时，鲁鲁修版的小智发出了一声＂shenyin＂。
“小智！”小智的老妈花子赶紧把鲁鲁修…啊不，是把小智搀扶起来。小智出事，最担心的就是这位母亲，尤其是发生了那么不科学的整容，很难说小智会不会出现什么问题，她不担心是不可能的，“怎么样？有哪里不舒服吗？”
“嗯…我没…”鲁鲁…啊不是小智。小智说到一半，半睁的眼睛就扫到了一旁的皮卡丘。
小智和皮卡丘诡异的对视了半秒，然后…
两人（一人一兽？）又干脆的昏了过去。
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六小时后，小智家二楼，小智的房间。
皮卡丘和鲁…小智在进行了近5分钟的诡异对视后，两人同时叹了口气。
第二次昏迷的时间很短，半小时后一人一兽就同时醒了。
小智在花了一个小时向大木博士和花子证明了自己没有失忆、没有异常感觉、没有多或少什么身体器官，只是换了一张帅到爆表的小白脸、换了一个优秀的声带以及莫名长高了10cm的身体以外，没有任何问题。
至于昏迷的原因，则表示完全不知道，只是说在昏迷前看到了天空中有一只身后带着一条彩虹，红色大型鸟类神奇宝贝。
之后，大木博士对比了各种资料，确定了小智看到的是关都地区的传说神奇宝贝——凤王。根据传说记载，大木博士推测小智的异变是因为凤王的特殊能力。
＂传说中在铃铃塔被烧毁时，有三只精灵被烧死在了塔中。后来被凤王救活，并给予能量变成了水君、炎帝和雷皇。从这点就可以看出凤王拥有给予其他精灵力量，使其个体受到优化的特殊能力。”大木博士向小智、花子、皮卡丘讲述自己的猜测，“假如凤王用这个能力优化了小智，那一切就解释的通了。而且常磐市附近也有一个人看到空中有一只红色精灵飞过，虽然没有照片，但也让小智的话的可信度提升了。”
接着，就是一系列繁琐的身体检查，确定小智和皮卡丘没有变成其他物种以后，才和已经放心了的花子回到小智家中。
虽然凤王是罪魁祸首的说法漏洞百出，但无论是大木博士还是花子都完全相信了这种说法。
毕竟在排除所有假象后，无论剩下的答案多么荒缪，但那肯定就是真相了……才怪。
还有一种可能，那就是——还有一个更荒谬的真相！
“虽然当初刚穿越的时候，确实感觉灵魂要被撕成两半了…”小智捂着脸说到，“但没想到真被撕成两半了。”
“彼此彼此，我也没有发觉记忆缺了一部分。”皮卡丘也用小短手做出了一个捂额头的动作，“亏我还去对小智的人品进行观察，谁知道完全做了无用功…”
之前说过的吧，当初穿越的时候主角觉得自己要被分成两半了。其实，也确实被分成两半了。
大约70%的灵魂穿越到了皮卡丘身上，剩下的30%…则潜伏在了不远处的小智身上。
本来嘛，只凭30%的灵魂，主角是不可能从已经在这个身体里呆了10年的小智手里抢过身体的。实际上，别说抢身体了，进入小智的身体后10分钟，那30%的灵魂就开始沉睡了。
70%的灵魂可以自由的用皮卡丘的身体里活动，不代表30%的灵魂可以长时间保持清醒状态。
一直沉睡了三天，那30%的灵魂才略微恢复了一点，在受到皮卡丘的两次电击刺激以后才醒了过来。
然后，在穿越时就进入主角灵魂的某系统出问题了。系统是灵魂绑定的，自然和灵魂一起被劈成两块了，但和不少双胞胎一样，两个系统也能互相感应的，发觉还有另一个系统存在，可本质上还是一个，系统就想重启再变回一个系统。
但现在和系统绑定的灵魂又有两个，变回一个以后又不知道改到哪个灵魂里去，就想把小智体内30%的灵魂抽出来，丢到皮卡丘的身体里去。
但皮卡丘和人类是不同物种，对灵魂的容量没有人类那么大，装一个人类70%的灵魂就是极限了，再塞也塞不进去。
然后系统就想把两部分灵魂一起装到小智的身体里去。但是之前再皮卡丘身体里的系统已经根据其神奇宝贝的身份设置好了，变成小智以后这一部分的系统就没法用了。就算重启也不能把已经设定好的系统完全推倒重来，只能略作修改。可再修改也不能用。
所以，系统经过长时间的死机以后，决定基本保持已经在皮卡丘体内生成好的系统，再把小智体内那部分生成一个子系统。把这个问题勉强应付过去了。
顺便说一下，原小智的灵魂，应该已经在系统的这一通乱搞之下，彻底崩溃，变成子系统让小智体内那部分灵魂恢复的养料了。小智身体的改变，则是为了让那部分灵魂能更好的适应身体。
至于第二次昏迷，是系统让两个灵魂之间联系加深而搞出来的。顺便把两部分灵魂的记忆共享了一下。
“嗯，这样一切都解释的通了。但..."小智吊着死鱼眼看着皮卡丘，＂你为啥知道的那么详细？＂
皮卡丘什么都没说，只是在小智面前调出改版后的系统光屏。灵魂觉醒后，小智虽然不能操作主系统，但也看得见主系统的光屏。皮卡丘也看得见小智的子系统的光屏，但不能对子系统进行操作。
无视了写着《百万技能系统2.0》的标题，小智看着那长长的系统通知，眼皮直跳。
＂叮，宿主灵魂完全恢复，系统更新……＂
＂叮，宿主灵魂异常，系统重置……＂
＂叮，重置失败，失败原因：宿主70%灵魂所在躯体无法完全容纳。系统分析处理方法……＂
＂叮，系统更改处理方法……＂
＂叮，重置失败，失败原因：系统类型错误，无法启动。系统分析处理方法……＂
＂叮，系统更改处理方法……＂
＂叮，子系统生成完毕，检测到崩溃状态灵魂能量，对宿主灵魂修复中……＂
＂叮，系统更新……＂
＂更新完毕＂
＂叮，对宿主两部分灵魂进行记忆共享完毕。＂
＂叮，本次更新：1生成子系统（宿主：樱井智），原系统更新为主系统。2新增商城功能。3主系统宿主数据化程度加深，自我锻炼提升效果减弱。4任务栏改版，自由属性点获得更简单，每日放送日常任务，触发特殊事件发布支线任务。5取消特殊技能[探测术],但可以再系统中查看友军战力。
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