大明軍队贸然加入战争的行为，顿时让这场战争的走向变的扑朔迷离了。
西方国家极为惊诧，在大明刚刚结束的跟美国的战争中，他们一度已经达成了某种共识，决定在必要的情况下，介入美国战争，阻止大明通过占领美国领土太过强大。
这次大明突然利用了日本的屠杀行为，介入了日本和清廷的战争，让西方再次开始互相勾连，通过对法国和美国两场战争，他们判断大明已经变得过于强大了，一个强大的，上亿人口的黄种人国家，在他们意识中造成的压力还是很大的，必须限制大明的扩张，已经成为共识。
英国早就开始限制大明的发展了，对美国开战还有削弱美国的作用，但一旦大明统一了中国地区，英国人认定他们在东亚的影响力，将被大明排挤出去。所以早在曾国藩还活着的时候，他们就出兵出力，帮助曾国藩打击太平天国了，扶持满清已经成为一项国策。只可惜清廷自己不争气，一边是英国希望扶持清廷权臣增强清廷的国力，一方面是满清朝廷在想方设法平衡这些权臣，限制他们的权力，一增一减清廷还是那个清廷，死气沉沉，没有希望。
但这样的清廷，英国也不想看到被大明统一，因为毕竟这是一个三一人口的国家，一旦由大明这个已经开始现代化的国家管理起来，所带来的国力增长是英国无法控制的。
于是英国立刻就向大明交涉，认为大明破坏了中立法，贸然介入战阵会让地区和平彻底失去控制。大明答复说，这不是法律问题，而是文明和野蛮的问题。不在一开始就制止日本的屠杀行为，会让更多的无辜平民遭受屠戮。大明反问英国，愿意承担一切道义责任吗？
日本的屠杀行为，让英国也很难接受，如果他们敢承担责任，他们相信大明肯定会将之后的所有平民伤亡，都推到英国的身上，让英国的荣誉受损。所以英国不肯承担这个责任，大坚决表达他们的态度，认为大明贸然介入战争是不合法的，同时也向日本施加了压力，要求日本约束军纪。
可大明的军事行动并没有停止，十万陆军很快就像旅顺发起了攻击，至于海军只限于防守，用海军冲击要塞的事情，大明海军已经吃过太多亏了，尤其现在的要塞已经被日军所控制，不是清军那群兵痞，不可能随便就放弃阵地的。
明军的进攻相当艰苦，这不是战斗力问题，刚刚结束的美国战争，让明军锻炼出了一批王牌部队，战斗力远胜于日军，武器装备上，大量装备毛瑟92式步枪也远胜日本的金钩单发步枪，大量装备的机枪更完胜日军，火炮上也占据绝对的优势，陆军重炮甚至可以跟旅顺的要塞炮互相轰击而不落下风。
旅顺的要塞体系营建工作，是李鸿章一手主持的，用料十足，设计科学合理，理论上来讲，这里是很难被攻克的。日俄战争中日军对这里的进攻就显示了这一点，尽管那时候俄国经营的更稳固，但现在的旅顺也不是轻易就能被攻克的地方。
日军大山岩部，两万余人，只用了一天时间就攻占了这里，如果说是打下来的，真的很难解释，不用具体情报就知道，这里几乎是让清军拱手让给了日军。
一个典型的例子是，当地最高文官，道员龚照玙临阵脱逃，战前就坐船逃到了烟台。
关于这个人的资历，则完全是李鸿章一手提拔起来的，提拔他的原因，不是因为能力，而是因为他有钱。龚照玙出生于安徽省合肥富户，是李鸿章的老乡。1871年投效北洋制造局当差，由监生捐纳同知、知府、道员，一路升迁靠的都是捐官。1890年经李鸿章推荐，总办旅顺船坞工程，并会办旅顺船坞营务处。这是一个毫无战场资历，仅仅凭着跟李鸿章的老乡关系加上金钱铺路爬上来的富家子弟，让这种人在旅顺指挥，结果早就注定。此战李鸿章罪责最大。
有一种说法是，当时守卫旅顺的各路淮军、湘军人马谁也不服谁，更不会服从一个文官，所以龚照玙才选择了逃跑，这种明显洗地的说辞不足为信，作为地方自高官员，即便明知必败也守土有责，放在满清制度没有崩坏的时代，这种官员必死无疑。满清入关之初，大量投降了满清的地方文官，在各路起义军的攻击下，都不敢放弃城池，反倒到了晚期，大量逃跑的。
追究原因，只看这个龚照玙后来的结局便知，他因为临阵脱逃，后来影响很坏，被定了一个斩首刑罚，但他手眼通天，白花花的银子砸下去，竟然没有执行，直到八国联军进北京的时候，他也只是被关押，而没有处斩，并且在八国联军时期被释放，回家乡病死了。
这显然是一个背景很深的人物，而他的背景毫无疑问就是李鸿章。李鸿章如此力保他，在看看他是李鸿章举荐的营建旅顺工程的官员，这项工程中到底有多少猫腻，不难猜测。李鸿章死后给家族留下了两千万两银子是哪里来的，不就是这种人贡献的吗。
所以从用人上来看，后来李鸿章背甲午战争的黑锅也不算冤，只是其他人也逃不开罪责罢了。
龚照玙跑了，看看留在旅顺的军官的表现，当时在旅顺的军官，全都是镇压太平天国起家的一干湘淮名将。张光前、黄仕林、姜桂题、程允和、卫汝成、赵怀业、徐邦道等诸将，这些人看不起龚照玙这种人，由总兵张光前出面召集诸将，推选出一个主帅。由资格最老的姜桂题出来承担主帅，可姜桂题目不识丁，才资平庸，诸军坐视观望、互相推诿。
这群人推举出一个目不识丁的老好人，依然是只为自己着想，其中徐邦道算是能打的将领了，守在主阵地上，不到半日就借口军队缺粮擅自离开，从李鸿章到淮军精英，都想着保存自己的实力，这场仗怎么打。其实如果能鼓起勇气，或者放下私心，淮军即便打不过日军，至少也不会将这种坚固要塞拱手让人。聂士成守凤凰岭就是例子，直到战争结束，他也没让日本人打下他的阵地，而他的軍队并不是什么精锐。
如果李鸿章能够在旅顺放一个能压得住场面的大将，日本人别说一天了，以他们还在使用青铜大炮的水平，一年都未必打的下来，可淮军老将刘铭传等人都不在这里，听说是重病在身，湘军老将刘锦棠也在这年病逝，无将可用是一大问题。但如果李鸿章能够下达严令，整个满清还是能找出一个大人物的，别的不说，派一个高级文官去旅顺，恐怕都比让这些武将互相推诿好的多，比如派一个兵部尚书去。
这种大方向山的指挥失当，责任应该由满清朝廷，或者说皇帝来负。
但旅顺之战，始终有一个迷局，那就是日军为什么在旅顺搞大屠杀？
如果说作战艰难，激怒了日军，这就是扯淡了，跟后来的日俄战争相比，这次旅顺之战几乎就没有战斗。
还有种说法，那就是日军为了震慑满清，效法蒙古人的政策，不希望看到抵抗。还是他们在朝鲜过的太好了，一路轻松推进，到了旅顺稍微遇到一点抵抗，就不满意了。
根据历史资料，是日本第一个进入旅顺的第一师团参谋长大寺安纯建议，使团长山地元治同意后，日军在旅顺发动了大屠杀，将旅顺城中两万多人杀尽。
这依然是军官的自行其是，不是伊藤博文等人的手段，不是给伊藤博文洗白，而是这种明显让日本出于国际道义不利地位的行为，日本政客是不会采取的。这场战争中，日本政客一直在试图让日本扮演一个文明国家的角色，他们允许了大量欧美记者随军采访，西方人看到的是日本建设合理的野战医院，不但医治日本伤员，还收容清军伤员，救治受伤百姓。而清军则是抢劫自己的老百姓，残杀日本俘虏，很多记者都拍下了被清军砍掉四肢，切掉了蛋蛋的日本俘虏尸体。因此随着战争的进行，日本在西方的形象越来越好，满清的野蛮形象越来越深入西方人的心理。
就在这时候，爆发了旅顺大屠杀，显然不是日本政府有意计划的，而且因为有大量随军记者，这件事连隐瞒都做不到。第一时间传遍了全世界。日本文官政府只能引导，而不能否认，最后的操作是，收买西方报纸，发表日本屠杀的都是装扮成老百姓的满清军人的谎言，最终随着满清战败而遮掩了过去。
但现在他们无法遮掩了，大明在世界上的影响力比日本大的多，大明搞宣传战的经验更丰富，在日本有确凿无疑的行为下，全世界都知道日本的屠杀行为，不但西方知道，大明还通过在整个中国的商业渠道，通过一个个大明的和满清的商会组织，将印刷的传单，传入了满清内陆，连四川的老百姓都知道，日本跟大清开战了，而且胜利后会屠城。此前一些偏远地区的百姓，甚至都不知道战争爆发的消息。
日本屠城的消息，通过报纸和传单，至少在整个中国地区的文人心理，留下了深深的恐慌，日本占了旅顺屠城，那么占了北亰呢，占了南京呢？
就在他们忧虑重重中，大明出兵了，并且在一个星期的激战之后，攻占了日军尚没有牢固控制的旅顺，明军付出了一万人的牺牲，两万五千日军，则战死了两万人，五千被俘虏。
攻占旅顺之前，大山岩等日本中高级将领集体切腹，五千俘虏中绝大多数是士兵，少数低级军官。
大明将日本军官的切腹，在全世界范围内宣传为畏罪自杀，同时在公开状态下，对俘虏的日本官兵进行了审判，判处他们犯有谋杀罪，所有军官一律枪决，普通士兵判处十年的苦役，发往大明殖民地服苦役。
世界舆论哗然，对大明将自己作为救世主一样的审判行为感到怪异，但各国政府关心的是，大明的军事行动，他们担心大明借此机会加入战争，火中取栗，占领满清领土。
但就在这时候，大明跟日本达成了协议，继续保持中立态度，开始从大连撤军，这种行为没有减轻西方人的疑惑，反而更让他们迷惑了起来。